以下、自己責任で。
Illustrator CSを終了する。 C:\Documents and Settings\ユーザー名\Application Data\Adobe\Adobe Illustrator CS 設定 をテキストエディタで開く。 /FileList { /file9 () /file8 () /file7 () /file6 () /file5 () /file4 () /file3 () /file2 () /file1 () /file0 (A:\\illustrator\\....以下略.....ai) } のようなところを検索し、 /FileList { (中略) } の部分を削除する。
いろいろやっていたら、このリストがごちゃごちゃしてきたので。
気分を変えて作業したいときにも有効かも?